現在即使治療最普通的食源性疾病的選擇也越來越少了。根據歐洲食品安全局（European Food Safety Authority）最新公布的報告，多重耐藥的沙門氏菌正在歐洲傳播。在歐盟的一些成員國中，人類和動物體內的彎曲桿菌對抗菌環丙沙星的耐藥性也很高。

《歐洲食品安全局-歐洲疾病預防控制中心歐盟摘要報告》分析了2013年人類、動物和食品中人畜共患和指示菌的耐藥性的數據。該報告稱，幸運的是，兩種細菌對主要抗菌藥的耐藥性還比較低。

歐洲食品安全局風險評估和科學援助部代理部長Marta Hugas說，“現在，人類、動物和食品中抗菌藥的耐藥性之間更具可比性了。這是抗擊抗菌藥耐藥性所取得的階段性的勝利?！?

歐洲食品安全局的首席科學家Mike Catchpole表示，“從人類和肉雞體內分離出來的彎曲桿菌對氟喹諾酮類抗菌藥的耐藥性很強，這是一個值得關注的問題，因為很大一部分的人類感染彎曲 桿菌的案例是在對雞肉的處理、加工以及消費過程中發生的。這種強度的耐藥性降低了對人類彎曲桿菌感染治療的有效性?！?

報告稱，人類和動物（尤其是肉雞和火雞）體內以及衍生肉制品中經常會檢測到耐普通抗菌藥的沙門氏菌。沙門氏菌的多重耐藥性比率很高（在人類體內的耐藥率為31.8%，火雞73.0%，育肥豬37.9%）。

報告稱，這份報告中關于人類和動物（肉雞、豬和牛）體內的多重耐藥克隆在繼續蔓延，這是個嚴肅的問題。

人類和動物（尤其是肉雞、豬和牛）體內頻繁地檢測到具有對普通抗菌藥耐藥性的彎曲桿菌。

食品方面，雞肉中發現了抗菌藥的耐藥性問題。人類體內的細菌對環丙沙星這種極為重要的抗菌藥的耐藥性極強，這意味著對嚴重性感染的治療方式的減少）。人 類和肉雞中有超過一半的彎曲桿菌的分離菌（分別是54.6%和54.5%）具有耐藥性，另外牛的體內彎曲桿菌的分離菌耐藥率為35.8%。人類和肉雞中有 三分之二的C大腸桿菌分離菌（分別是66.6%和68.8%）具有耐藥性，另外豬的C大腸桿菌分離菌耐藥率為31.1%。